Хромосомный микроматричный анализ

Определите вариации количества копий ДНК быстро и эффективно.

CNV+SV на одной микроматице уже доступно!

ХМА разработан специально для проведения максимально точного цитогенетического теста.

Но, сегодня он может больше.

Хромосомный микроматричный анализ

Определите вариации количества копий ДНК быстро и эффективно.

ХМА разработан специально для проведения максимально точного цитогенетического теста.

Но сегодня он может больше.

ЧТО СЛЕДУЕТ ЗНАТЬ, ПЕРЕД ТЕМ КАК ЗАКАЗАТЬ ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ

Хромосомный микроматричный анализ (ХMA) может быть мощным диагностическим инструментом при правильном использовании. Однако технология ХMA и сам процесс тестирования отличается от других лабораторных тестов. В этом разделе мы приводим базовую информацию об этом исследовании и ответы на наиболее часто задаваемые вопросы. Это поможет принять, как работает тест, что он выявляет и когда он может быть наиболее полезным.

Шкала геномных изменений

Хромосома

100 миллионов баз

CNV

От 30,000 до 3 миллионов баз

Один ген

3,000 баз

Изменение последовательности

1 база

Хромосомный микроматричный анализ (ХMA) ищет дополнительные (дупликации) или отсутствующие (делеции) хромосомные сегменты, которые иногда называют вариациями числа копий (CNV). К ним относятся:

- Делеции и дупликации хромосомных сегментов, которые слишком малы, чтобы их можно было увидеть под микроскопом, но которые могут содержать несколько генов.
- Большинство аномалий числа хромосом (трисомию, моносомию и т.д.), включая синдром Дауна.
- Несбалансированные перестройки структуры хромосом (транслокации и т.д.).

В зависимости от платформы ХMA также может обнаруживать следующее:

- Чрезмерную гомозиготность, наводящую на мысль о риске рецессивного заболевания или болезнях геномного импринтинга.
- Триплоидию и другие дупликации всего набора хромосом (тетраплоидию и т.д.).

Как и в случае с традиционным кариотипированием, хромосомный микроматричный анализ может выявить мозаицизм (смесь нормальных и аномальных клеток), превышающий 20-25%. Частота обнаружения зависит от конкретной платформы тестирования.

Ни один тест не может исключить все генетические заболевания. Некоторые варианты требуют другого теста, а некоторые области технически сложно выделить и проанализировать.

ХMA не обнаруживает:

- Небольшие изменения в последовательности отдельных генов (точечные мутации).
- Крошечные дупликации и делеции сегментов ДНК в пределах одного гена (например, синдром ломкой X-хромосомы).
- Сбалансированные хромосомные перестройки (сбалансированные транслокации, инверсии).

Ограничения ХMA также зависят от используемой методологии. Большинство таких тестов не может обнаружить мозаицизм ниже 20-25%. Некоторые платформы не обнаруживают чрезмерную гомозиготность, триплоидию и др.

Микроматрица - это микрочиповая платформа для анализов, которая позволяет выполнять большой объем автоматизированных исследований множества фрагментов ДНК одновременно. Чипы ХMA используют метки или зонды, которые связываются с определенными областями хромосом. Генетический материал пациента с контрольным образцом сравнивают с помощью компьютерного анализа. Разница между ДНК пациента и контрольным образцом называется вариацией.

ХMA однозначно лучше пройти людям, у которых не выявили ни один широко распространенный хромосомный синдром наподобие синдрома Дауна, но которые демонстрируют любое из следующего:

- Задержку развития/интеллектуальные нарушения.
- Расстройства аутистического спектра.
- Множественные врожденные аномалии, в том числе лицевые дисморфии.

ХMA также может быть наиболее выгодным по экономическим соображениям тестом, когда у пациента заподозрили более одного генетического расстройства. Это можно учесть заранее, если у пациента обнаруживаются признаки, обычно не связанные с установленным диагнозом.

Врач-генетик поможет определить, требуется ли дополнительное тестирование, такое как ХMA.

Специалисты исследуют ХMA для использования в других группах пациентов, и применение этого анализа со временем будет расширяться. Особенно полезно это будет в случаях, когда другие тесты не помогли поставить диагноз, например:

- Необъяснимые судорожные расстройства.
- Задержка роста.
- Психические заболевания.
- Нервно-мышечные расстройства.

Исследование ХMA может стать шагом к получению более квалифицированной и целевой помощи семьям, в которых есть дети с ранее не диагностированными состояниями. Вариант, найденный с помощью ХMA, может не только дать долгожданное объяснение клиническим проявлениям пациента, но также повлиять следующим образом:

- Специфические когнитивные, развивающие и функциональные профили, связанные с некоторыми вариантами, определяют дальнейшее лечение.
- Все синдромы получат определенные баллы по возможным осложнениям, которые в ином случае легко упустить.
- Семейные исследования помогут планировать репродуктивное здоровье и проводить скрининг членов группы риска.

В 2010 году Американский колледж медицинской генетики рекомендовал ХMA в качестве теста первого уровня среди людей с задержкой развития, умственными нарушениями, расстройствами аутистического спектра и множественными врожденными аномалиями.

ХMA в 10-15% завершается диагнозом, что значительно лучше, чем ~3% при традиционном хромосомном анализе. Также ХMA способен обнаруживать большинство хромосомных нарушений, выявляемых с помощью кариотипирования.

Кариотипирование традиционно подходит пациентам с признаками определенных хромосомных аномалий, таких как синдром Дауна. Для таких состояний, как синдром ломкой X-хромосомы, больше подходит таргетное молекулярно-генетическое исследование, ведь ХМА их не диагностирует. Однако ХМА может быть полезен в случаях, когда все эти тесты не смогли поставить диагноз, когда у пациента есть диагноз с необычным течением или когда наблюдается сразу несколько состояний.

Результаты могут включать:

- Характерные физические особенности.
- Группы врожденных пороков развития.
- Определенные когнитивные профили и профили, связанные с развитием.
- Четкую схему наследования в семье.

В случае сомнений проконсультируйтесь со специалистом по генетике.

В целом, генетическое тестирование стоит дороже, чем обычные лабораторные анализы. Зато у пациентов с определенными показаниями вероятность постановки диагноза намного выше.

Существует риск неопределенных, неинформативных или неожиданных результатов. Тем не менее, отрицательный результат не всегда бесполезен при поиске диагноза. Потенциальное клиническое и психосоциальное воздействие различных результатов следует индивидуально оценивать в каждом конкретном случае.