Медико-генетический центр
лаборатория молекулярной патологии
Связаться с нами
Связаться с нами
Бесплатная горячая линия:
Есть вопросы?
Позвоните нам +7 (800) 350-12-26 или заполните форму ниже.
Мы рады, что вы готовы сделать заказ
Позвоните нам +7 (800) 350-12-26 или заполните форму ниже, и мы перезвоним вам.
Заказать звонок
Наш консультант перезвонит вам и поможет выбрать подходящий продукт
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) для детей
Определите, связаны ли проблемы развития ребенка с состоянием, вызванным хромосомной аномалией.
Хромосомный дисбаланс и вариации числа копий генов встречаются в 35% всех врожденных дефектов
Мультифакториальные причины
Хромосомный дисбаланс
Моногенные заболевания
Вариации числа копий генов
Тератогенные факторы
Относительный вклад моногенных дефектов, хромосомных аномалий, CNVs, многофакторных состояний и тератогенов в возникновении врожденных дефектов.
Thompson and Thompson, Genetics in medicine, 2016
Хромосомный микроматричный анализ выявляет дополнительные или недостающие фрагменты хромосом примерно у 15-20% детей с задержкой развития и/или врожденными дефектами
⠀⠀Множественные врожденые пороки развития
Показания к проведению хромосомного микроматричного анализа
Чаще всего причиной множественных пороков развития являются средние и крупные микроделеции с вовлечением множества генов. Такие хромосомные изменения легко детектируются при помощи ХМА.
⠀⠀Неспецифичный,
«широкий» фенотип
«широкий» фенотип
При неспецифичном фенотипе пациента выбор таргетной диагностической панели вызывает трудности. Полногеномные методы в этом случае имеют преимущества. ХМА определяет вариации копий всех клинически значимых генов.
⠀⠀Задержка развития, аутизм и умственная отсталость
Наиболее частой причиной аутизма, умственной отсталости и задержки развития является хромосомная патология. ХМА в этом случае обладает высокой диагностической эффективностью по сравнению с другими методами.
Другие показания к исследованию:
- Низкий вес при доношенной беременности.
- Малые аномалии развития (особенности фенотипа).
- Аномальное строение половых органов, неопределенный пол.
- Выраженные отклонения в росте (низкий, высокий рост) и размерах головы (микроцефалия, макроцефалия).
- Отставание в физическом и половом развитии.
- Малые аномалии развития (особенности фенотипа).
- Аномальное строение половых органов, неопределенный пол.
- Выраженные отклонения в росте (низкий, высокий рост) и размерах головы (микроцефалия, макроцефалия).
- Отставание в физическом и половом развитии.
- Первичная или вторичная аменорея, или ранняя менопауза.
- Аномальная спермограмма – азооспермия или выраженная олигозооспермия.
- Клинические проявления синдрома микроструктурной аномалии.
- Выявление маркерных хромосом или неиденцифицируемых аномалий при стандартном анализе кариотипа.
- Аномальный кариотип у родителей.
- Аномальная спермограмма – азооспермия или выраженная олигозооспермия.
- Клинические проявления синдрома микроструктурной аномалии.
- Выявление маркерных хромосом или неиденцифицируемых аномалий при стандартном анализе кариотипа.
- Аномальный кариотип у родителей.
Хромосомный микроматричный анализ как тест первой линии рекомендован профессиональными сообществами медицинских генетиков
ACMG (2013)
European Cytogenetics Association (2018)
Почему хромосомный микроматричный анализ является тестом первой линии для пациентов с пороками развития
Традиционно первым тестом при подозрении на генетическую патологию был кариотип.
Стоимость хромосомного микроматричного анализа сопоставима со стоимостью кариотипа .
Сегодня ему на смену пришел хромосомный микроматричный анализ, который в 800 раз чувствительнее кариотипа и выявляет намного больше патологических изменений в геноме.
Хромосомный микроматиричный анализ — наиболее экономичный способ выявить хромосомную патологию и определить тактику дальнейшего обследования пациента.
Что определяет хромосомный микроматричный анализ
- Автоматизированный анализ анеуплоидий позволяет быстро выдавать отчет.
- Определение мозаичных форм анеуплоидий от 10% мозаицизма.
- Определение происхождения дополнительной хромосомы или делетированной копии.
- Выявление дополнительных копий всех или нескольких хромосом - триплоидии и тетраплоидии.
- Определение мозаичных форм полиплоидий от 10% мозаицизма.
- Определение происхождения дополнительного набора хромосом.
- Микроделеции размером от 25 КБ и микродупликации от 50 КБ во всех участках генома.
- Микроделеции размером от 10 КБ и микродупликации от 20 КБ во всех участках генома в области клинически релевантных генов.
- Точное определение координат дисбаланса и его положение относительно кодирующих (экзонов) и других функционально активных участков гена.
- Аннотация обнаруженных CNV по базам данных патогенных и непатогенных CNV, собственной базы данных лаборатории «Геномед».
- Определение происхождения структурного дисбаланса.
- Определение мозаицизма от 10% (зависит от размера дисбаланса).
Участки потери гетерозиготности (LOH) в ДНК появляются в случае наследования двух идентичных фрагментов (одинаковых у обоих родителей) или наследования двух копий фрагмента ДНК от одного из родителей.
Определение участков потери гетерозиготности размером от 100 КБ.
Определение участков потери гетерозиготности размером от 100 КБ.
- Расчет доли LOH относительно всего генома и вероятности близкородственного брака родителей (или их происхождения из закрытой популяции).
- Дифференцировка LOH, происходящих от обоих родителей, и однородительских дисомий (ОРД).
- Определение происхождения гомозиготного участка при однородительской дисомии.
- Аннотирование обнаруженной перестройки в отношении генов, связанных с болезнями импринтинга.
Хромосомный микроматричный анализ позволяет определять число копий генов SMN1 и SMN2, имеющих гомологи, и трудно определяемые другими методами.
- Обнаруживает делеции гена SMN1.
- Позволяет точно определить количество копий (0, 1, 2, 3 и ≥4) экзонов 7 и 8 генов SMN1 и SMN2.
- Обнаруживает варианты в гене SMN2, являющиеся модификаторами заболевания.
Наличие на микроматрице полиморфных маркеров позволяет определять варианты в генах, связанных с аутосомно-доминантными и аутосомно-рецессивными заболеваниями.
- 95 генов аутосомно-доминантных заболеваний.
- 87 генов, связанных с аутосомно-рецессивными заболеваниями.
- 37 вариантов в гене CFT.
- 18 вариантов в гене PAI.
Какой тест выбрать?
Для постнатальной диагностики ХМА доступен в форматах «Стандартный» и «Экзон»
ХМА «Стандартный»
ХМА «Экзон»
Основные характеристики
Всего маркеров
Детектирующая способность в отношении микроделеций
Рекомендации по применению
> 100 kb для всего генома;
> 10 kb для экзонов клинически релевантных генов.
> 10 kb для экзонов клинически релевантных генов.
6,85
1,16
Микроматрица высокой плотности с повышенным покрытием в клинически значимых регионах для выявления структурных аберраций, таких как CNV, хромосомный дисбаланс, LOH, UPD и мозаицизм.
Идеально подходит для специалистов и пациентов, которым нужно выявить все хорошо известные микроделеционные или дупликационные синдромы, а также неописанные ранее хромосомные нарушения с высокой точностью.
Тест также определяет число копий гена SMN1 и еще 500 мутаций в 120 генах.
Тест также определяет число копий гена SMN1 и еще 500 мутаций в 120 генах.
Микроматрица с наибольшей плотностью маркеров для выявления структурных аберраций, таких как CNV, хромосомный дисбаланс, LOH, UPD и мозаицизм с высочайшей точностью.
> 25 kb для всего генома;
> 1 kb для экзонов всех генов.
> 1 kb для экзонов всех генов.
Рекомендуется специалистам и пациентам, которые хотят добиться максимально возможного уровня обнаружения хромосомной патологии. Обычно назначается, если другие исследования были неинформативными или в сложных случаях. Получите консультацию нашего специалиста перед проведением исследования.
Заявка на ХМА "Стандартный"
Заявка на ХМА "Экзон"
Какой тест выбрать?
Для постнатальной диагностики ХМА доступен в форматах «Стандартный» и «Экзон»
Исследуемый материал
Набор буккальных тампонов:
Обычно для исследования требуется несколько миллилитров венозной крови, собранной в пробирку с ЭДТА.
При невозможности получить образец венозной крови используют капиллярную кровь, собранную в соответствии с инструкцией.
Когда нельзя собрать достаточно крови для анализа, можно получить ДНК из клеток с внутренней стороны щеки пациента.
При невозможности получить образец венозной крови используют капиллярную кровь, собранную в соответствии с инструкцией.
Когда нельзя собрать достаточно крови для анализа, можно получить ДНК из клеток с внутренней стороны щеки пациента.
Позволяет врачам, не имеющим возможности флеботомии, забирать образцы прямо на приеме.
Освобождает пациентов от повторной поездки в лабораторию.
Предоставляет пациентам удобную альтернативу.
Делает генетическое тестирование более доступным для врачей общей практики, педиатров, детских неврологов и других врачей.
Освобождает пациентов от повторной поездки в лабораторию.
Предоставляет пациентам удобную альтернативу.
Делает генетическое тестирование более доступным для врачей общей практики, педиатров, детских неврологов и других врачей.
Для врача
Для пациента
Заполните направление в Личном кабинете или в бумажной форме.
Сообщите пациенту адрес медицинского офиса или телефон лаборатории «Геномед».
Все адреса можно найти здесь
Все адреса можно найти здесь
Получите подробный отчет о результатах.
Оцените результаты самостоятельно.
Если у вас есть вопросы о результатах или их клинических последствиях, наши врачи-генетики готовы обсудить их.
Для всех врачей доступна система анализа, аннотирования и интерпретации данных «Геномед».
Если вы получили устную рекомендацию врача сделать хромосомный микроматричный анализ, то:
Заполните форму заказа исследования на сайте.
Оплатите исследование на сайте.
Посетите один из наших медицинских офисов или закажите комплект для сбора биоматериала.
Результат исследования будет готов через 6 рабочих дней.
Если у вас есть вопросы по результатам ХМА или их клиническом значении, наши специалисты ответят на них.
С чего начать?
Следуйте этим простым шагам, чтобы начать работу:
В некоторых случаях выполнение исследования возможно в рамках государственных гарантий оказания медицинской помощи или при поддержке благотворительных фондов. Свяжитесь с нами чтобы узнать подробности.
*
Что будет в заключении по результатам анализа?
Все лабораторные данные интерпретируются врачом-генетиком с целью поиска вероятных патогенных вариантов. Учитывается характер перестройки, ее размер и локализация, гены, входящие в область перестройки, наличие ее в базах данных патогенных и нормальных вариантов и многие другие признаки с учетом фенотипа пациента.
Образец заключения
Если перестройка имеет признаки патогенности, она включается в отчет с точным описанием, координатами и графическим изображением.
Вариации числа копий классифицируются на основе известной, прогнозируемой или возможной патогенности и сообщаются с пояснительными комментариями, детализирующими их потенциальную или известную клиническую значимость.
При интерпретации результатов важно понимать, что вариации числа копий обнаруживаются у всех, включая пациентов с аномальными фенотипами и здоровых людей. Поэтому определение клинической значимости редкого или нового изменения числа копий может быть сложной задачей. Может понадобиться тестирование родителей для оценки патогенности обнаруженного дисбаланса.
Хотя большинство изменений количества копий, наблюдаемых при ХМА, легко интерпретируются как патогенные или доброкачественные, в некоторых случаях для точной оценки обнаруженных изменений может потребоваться подробное описание фенотипа и дополнительные лабораторные или инструментальные методы обследования.
Вариации числа копий с неизвестным значением включаются в отчет, когда по меньшей мере 1 ген участвует в делеции, превышающей 1 мегабазу (Мб), или в дупликации, превышающей 2 Мб.
В заключение всегда включается процент гомозиготных участков (для аутосом), а также подробная информация об участках с потерей гетерозиготности, когда на хромосомах, связанных с UPD, обнаружено больше 5 Мб для терминальных LOH или больше 10 Мб для интерстициальных LOH.
В результате исследования могут быть случайные находки, не связанные с первоначальной причиной направления. В таких случаях могут потребоваться исследования других членов семьи, чтобы помочь интерпретировать результаты.
При выявлении повышенной гомозиготности может возникнуть необходимость дополнительных исследований для подтверждения однородительской дисомии. По запросу врача может быть представлен список клинически релевантных генов для их прицельного анализа на наличие мутаций в генах, связанных с аутосомно-рецессивными расстройствами.
Что дальше?
Если обнаружена патогенная перестройка, врач-генетик консультирует пациента относительно ее влияния на здоровье, по репродуктивными рискам и другим вопросам.
В некоторых случаях необходимо дополнительное обследование родителей пациента с целью установления происхождения дисбаланса (унаследованный/нет).
В медико-генетическом центре «Геномед» вы всегда можете получить консультацию врача-генетика по результатам ХМА или по другим вопросам.
Хромосомный микроматричный анализ выявляет определенную хромосомную патологию с высокой точностью. Если она не выявлена, это означает, что хромосомных перестроек, детектируемых этим методом в рамках валидированной точности метода, действительно нет.
Однако существуют и другие генетические дефекты, которые не выявляются хромосомным микроматричным анализом. Если у врача сохраняется подозрение на генетическую патологию, правильно будет использовать другие методы обследования пациента.
Следует также понимать, что интерпретация результатов других исследований более эффективна при сопоставлении их с результатами хромосомного микроматричного анализа.
Коростелев Сергей Анатольевич
Врач-генетик, д.м.н., профессор
Врач-генетик, к.м.н., руководитель отделения «Генетика»
Заведующая отделом лаборатории направления микроматричного анализа
Кто делает это исследование для вас
Канивец Илья Вячеславович
Булева Оксана Николаевна
Что еще?
Панели генов
Если фенотип пациента соответствует группе заболеваний, правильным будет анализ группы генов (панели), соответствующих этим заболеваниям методом секвенирования нового поколения.
Клинический экзом
Если у пациента неспецифичный (широкий) фенотип или причина заболевания не установлена ранее проведенными исследованиями, полное исследование всех клинически значимых генов может быть более эффективным.
Полный геном
Полное секвенирование генома дополнительно выявляет сбалансированные перестройки и CNV размером от 50 до 10000 нуклеотидов, тандемные повторы, а также варианты митохондриальной ДНК.